Dua tim teratas di setiap dari 12 grup, bersama dengan delapan peringkat ketiga terbaik, maju ke fase knockout.
Fase knockout dimulai dengan babak 32, yang diperkenalkan untuk pertama kalinya di Piala Dunia setelah ekspansi turnamen dari 32 menjadi 48 tim.
Kemudian ada babak 16, diikuti oleh perempat final, semifinal, dan playoff untuk tempat ketiga. Final akan diadakan pada 19 Juli.
FIFA menggunakan catatan head-to-head sebagai pemutus tiebreaker utama untuk tim yang memiliki poin sama untuk pertama kalinya di Piala Dunia.
Haiti jadi tim pertama yang pulang dari Piala Dunia setelah mengalami kekalahan 3-0 dari Brasil pada hari Jumat, 19 Juni. Ini adalah turnamen pertama mereka sejak 1974, dan mereka juga kalah 1-0 dari Skotlandia di pertandingan pertama mereka.
Turki segera mengikuti langkah tersebut, tersingkir dari turnamen setelah kalah 1-0 dari Paraguay yang bermain dengan 10 orang pada hari Jumat. Mereka juga mengalami kekalahan mengejutkan 2-0 dari Australia di pertandingan grup pertama ā penampilan pertama mereka di turnamen setelah 24 tahun.
Tunisia jadi tim ketiga yang tereliminasi setelah kalah 4-0 dari Jepang pada hari Sabtu, 20 Juni. Kekalahan ini datang tak lama setelah mereka mengalami kekalahan telak 5-1 dari Swedia di pertandingan pembuka. Tunisia adalah tim Afrika pertama yang menang dalam pertandingan Piala Dunia saat mengalahkan Meksiko di 1978, tapi mereka belum pernah melangkah lebih jauh dari fase grup.